MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saprospira grandis str. Lewin plasmid unnamed

Total Repeats: 1143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016936	TTA	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016936	TGA	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016936	TGT	2	6	21	26	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016936	T	7	7	34	40	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016936	GCA	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016936	GCG	2	6	61	66	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016936	CTG	2	6	138	143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016936	TTAA	2	8	248	255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016936	TAAA	2	8	281	288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016936	GGC	2	6	345	350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016936	GCC	2	6	354	359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016936	CAG	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016936	GCC	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016936	GGC	2	6	435	440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016936	A	9	9	511	519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016936	GCG	2	6	558	563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732331
17	NC_016936	TCT	2	6	585	590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732331
18	NC_016936	ATA	2	6	615	620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379732331
19	NC_016936	AAC	2	6	649	654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732331
20	NC_016936	TCA	2	6	667	672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732331
21	NC_016936	C	6	6	744	749	0 %	0 %	0 %	100 %	379732331
22	NC_016936	CCA	2	6	754	759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732331
23	NC_016936	CGC	2	6	829	834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732331
24	NC_016936	TCT	2	6	873	878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732331
25	NC_016936	CAAT	2	8	885	892	50 %	25 %	0 %	25 %	379732331
26	NC_016936	GCA	2	6	976	981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732331
27	NC_016936	TTG	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732331
28	NC_016936	GACAA	2	10	1102	1111	60 %	0 %	20 %	20 %	379732331
29	NC_016936	CTT	2	6	1141	1146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732331
30	NC_016936	ATC	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732331
31	NC_016936	ATA	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379732331
32	NC_016936	TGC	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732331
33	NC_016936	GAG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379732331
34	NC_016936	CGC	2	6	1373	1378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732331
35	NC_016936	GCT	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732331
36	NC_016936	TA	3	6	1437	1442	50 %	50 %	0 %	0 %	379732331
37	NC_016936	TTTG	2	8	1470	1477	0 %	75 %	25 %	0 %	379732331
38	NC_016936	T	9	9	1483	1491	0 %	100 %	0 %	0 %	379732331
39	NC_016936	ATTTT	2	10	1536	1545	20 %	80 %	0 %	0 %	379732332
40	NC_016936	TGT	2	6	1679	1684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732332
41	NC_016936	CAC	2	6	1685	1690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732332
42	NC_016936	TATC	2	8	1726	1733	25 %	50 %	0 %	25 %	379732332
43	NC_016936	GTT	2	6	1770	1775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732332
44	NC_016936	GAC	2	6	1800	1805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732332
45	NC_016936	GAAA	2	8	1859	1866	75 %	0 %	25 %	0 %	379732332
46	NC_016936	CTA	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732332
47	NC_016936	CCG	2	6	1943	1948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732332
48	NC_016936	TTGT	2	8	1975	1982	0 %	75 %	25 %	0 %	379732332
49	NC_016936	CTG	2	6	2009	2014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732332
50	NC_016936	ATAAA	2	10	2039	2048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016936	TATT	2	8	2072	2079	25 %	75 %	0 %	0 %	379732333
52	NC_016936	TTG	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732333
53	NC_016936	GGT	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379732333
54	NC_016936	CCG	2	6	2203	2208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732333
55	NC_016936	CTT	2	6	2326	2331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732333
56	NC_016936	CGG	2	6	2338	2343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732333
57	NC_016936	GCC	2	6	2484	2489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732333
58	NC_016936	CGA	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732333
59	NC_016936	GCA	2	6	2598	2603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732333
60	NC_016936	CCCGC	2	10	2607	2616	0 %	0 %	20 %	80 %	379732333
61	NC_016936	CTTCT	2	10	2726	2735	0 %	60 %	0 %	40 %	379732333
62	NC_016936	GCCA	2	8	2747	2754	25 %	0 %	25 %	50 %	379732333
63	NC_016936	GCT	2	6	2821	2826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732333
64	NC_016936	CAA	2	6	2852	2857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732333
65	NC_016936	GAA	2	6	2925	2930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732333
66	NC_016936	GAT	2	6	3103	3108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732333
67	NC_016936	CTTTT	2	10	3128	3137	0 %	80 %	0 %	20 %	379732333
68	NC_016936	GCC	2	6	3147	3152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732333
69	NC_016936	CAA	2	6	3228	3233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732333
70	NC_016936	GC	3	6	3415	3420	0 %	0 %	50 %	50 %	379732333
71	NC_016936	AAC	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732333
72	NC_016936	CCA	2	6	3444	3449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732333
73	NC_016936	CT	3	6	3533	3538	0 %	50 %	0 %	50 %	379732333
74	NC_016936	CTT	2	6	3595	3600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732333
75	NC_016936	CTTT	2	8	3676	3683	0 %	75 %	0 %	25 %	379732334
76	NC_016936	TCT	2	6	3799	3804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732334
77	NC_016936	T	6	6	3852	3857	0 %	100 %	0 %	0 %	379732334
78	NC_016936	T	7	7	3862	3868	0 %	100 %	0 %	0 %	379732334
79	NC_016936	TGC	2	6	3893	3898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732334
80	NC_016936	ATCCC	2	10	3920	3929	20 %	20 %	0 %	60 %	379732334
81	NC_016936	CAT	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732334
82	NC_016936	ATG	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732334
83	NC_016936	ACC	2	6	4159	4164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732334
84	NC_016936	CAA	2	6	4431	4436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732334
85	NC_016936	GGC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732334
86	NC_016936	TGA	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732334
87	NC_016936	CCCA	2	8	4506	4513	25 %	0 %	0 %	75 %	379732334
88	NC_016936	CCA	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732334
89	NC_016936	TCA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732334
90	NC_016936	T	6	6	4640	4645	0 %	100 %	0 %	0 %	379732334
91	NC_016936	T	6	6	4698	4703	0 %	100 %	0 %	0 %	379732334
92	NC_016936	AAT	2	6	4803	4808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379732334
93	NC_016936	CCT	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379732334
94	NC_016936	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379732334
95	NC_016936	CTT	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732334
96	NC_016936	GTC	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732334
97	NC_016936	AGAGA	2	10	5085	5094	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016936	A	6	6	5125	5130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016936	GCAA	2	8	5133	5140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016936	TCT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016936	G	6	6	5166	5171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016936	T	6	6	5296	5301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016936	GCGG	2	8	5325	5332	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016936	GCG	2	6	5371	5376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016936	CTG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016936	TAAA	2	8	5569	5576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016936	GCA	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732335
108	NC_016936	GGC	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732335
109	NC_016936	GCC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732335
110	NC_016936	GCAG	2	8	5758	5765	25 %	0 %	50 %	25 %	379732335
111	NC_016936	A	6	6	5774	5779	100 %	0 %	0 %	0 %	379732335
112	NC_016936	TTC	2	6	5789	5794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732335
113	NC_016936	AAAG	2	8	5836	5843	75 %	0 %	25 %	0 %	379732336
114	NC_016936	A	6	6	6056	6061	100 %	0 %	0 %	0 %	379732336
115	NC_016936	TTG	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732336
116	NC_016936	GAT	2	6	6101	6106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732336
117	NC_016936	CCA	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379732336
118	NC_016936	ATT	2	6	6146	6151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732336
119	NC_016936	TCA	2	6	6177	6182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732336
120	NC_016936	AGA	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732336
121	NC_016936	GTT	2	6	6380	6385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732336
122	NC_016936	A	7	7	6447	6453	100 %	0 %	0 %	0 %	379732336
123	NC_016936	ATG	2	6	6483	6488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732336
124	NC_016936	GC	3	6	6534	6539	0 %	0 %	50 %	50 %	379732336
125	NC_016936	TCA	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732336
126	NC_016936	GGC	2	6	6602	6607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732336
127	NC_016936	GCTT	2	8	6627	6634	0 %	50 %	25 %	25 %	379732336
128	NC_016936	A	6	6	6640	6645	100 %	0 %	0 %	0 %	379732336
129	NC_016936	ATG	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732336
130	NC_016936	A	6	6	6692	6697	100 %	0 %	0 %	0 %	379732336
131	NC_016936	AGA	2	6	6724	6729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732336
132	NC_016936	TGC	2	6	6793	6798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732336
133	NC_016936	GGA	2	6	6880	6885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379732336
134	NC_016936	A	6	6	6885	6890	100 %	0 %	0 %	0 %	379732336
135	NC_016936	T	7	7	6942	6948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016936	AT	3	6	6987	6992	50 %	50 %	0 %	0 %	379732337
137	NC_016936	AGA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732337
138	NC_016936	AGC	2	6	7045	7050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732337
139	NC_016936	AGC	2	6	7128	7133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732337
140	NC_016936	ATCA	2	8	7187	7194	50 %	25 %	0 %	25 %	379732337
141	NC_016936	CGG	2	6	7221	7226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732337
142	NC_016936	GAT	2	6	7256	7261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732337
143	NC_016936	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732337
144	NC_016936	AGA	2	6	7318	7323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732337
145	NC_016936	ATCT	2	8	7346	7353	25 %	50 %	0 %	25 %	379732337
146	NC_016936	TCA	2	6	7423	7428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732337
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148	NC_016936	TGAT	2	8	7518	7525	25 %	50 %	25 %	0 %	379732337
149	NC_016936	GCT	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732337
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151	NC_016936	GCCC	2	8	7663	7670	0 %	0 %	25 %	75 %	379732337
152	NC_016936	ACCG	2	8	7672	7679	25 %	0 %	25 %	50 %	379732337
153	NC_016936	GAA	2	6	7775	7780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379732337
154	NC_016936	CATT	2	8	7786	7793	25 %	50 %	0 %	25 %	379732337
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156	NC_016936	CTG	2	6	8045	8050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732337
157	NC_016936	CCCA	2	8	8077	8084	25 %	0 %	0 %	75 %	379732337
158	NC_016936	ACA	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732337
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161	NC_016936	TGA	2	6	8209	8214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732337
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163	NC_016936	CAT	2	6	8320	8325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732337
164	NC_016936	CGG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732337
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166	NC_016936	TGA	2	6	8389	8394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732337
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171	NC_016936	CT	3	6	8519	8524	0 %	50 %	0 %	50 %	379732337
172	NC_016936	TGG	3	9	8652	8660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379732337
173	NC_016936	CAA	2	6	8696	8701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732337
174	NC_016936	CT	3	6	8714	8719	0 %	50 %	0 %	50 %	379732337
175	NC_016936	ATG	2	6	8739	8744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732337
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177	NC_016936	TTG	2	6	8783	8788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379732337
178	NC_016936	AGC	2	6	8915	8920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732337
179	NC_016936	TAT	2	6	8944	8949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732337
180	NC_016936	ATT	2	6	9086	9091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732337
181	NC_016936	TGA	2	6	9139	9144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732337
182	NC_016936	ATT	2	6	9158	9163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732337
183	NC_016936	GCC	2	6	9174	9179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732337
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187	NC_016936	ACT	2	6	9515	9520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732337
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213	NC_016936	CTG	2	6	10929	10934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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221	NC_016936	TCGA	2	8	11263	11270	25 %	25 %	25 %	25 %	379732339
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230	NC_016936	GCC	2	6	11682	11687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732339
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239	NC_016936	CAA	2	6	12186	12191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379732339
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241	NC_016936	CAG	2	6	12315	12320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732339
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243	NC_016936	CTA	2	6	12367	12372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379732339
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246	NC_016936	CGG	2	6	12533	12538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732339
247	NC_016936	GCC	2	6	12564	12569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732339
248	NC_016936	GGC	2	6	12705	12710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732340
249	NC_016936	GCC	2	6	12714	12719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379732340
250	NC_016936	GCA	2	6	12759	12764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_016936	A	6	6	12781	12786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_016936	TCA	2	6	12795	12800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_016936	GCA	2	6	12805	12810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732341
254	NC_016936	A	7	7	12814	12820	100 %	0 %	0 %	0 %	379732341
255	NC_016936	AGC	2	6	12885	12890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732341
256	NC_016936	GCA	2	6	12997	13002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732341
257	NC_016936	GCA	2	6	13006	13011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732341
258	NC_016936	ATT	2	6	13013	13018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732341
259	NC_016936	T	6	6	13027	13032	0 %	100 %	0 %	0 %	379732341
260	NC_016936	TGG	2	6	13092	13097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379732341
261	NC_016936	AGC	2	6	13203	13208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732341
262	NC_016936	ATG	2	6	13239	13244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379732341
263	NC_016936	CTG	2	6	13287	13292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379732341
264	NC_016936	ATT	2	6	13302	13307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379732341
265	NC_016936	TGAT	2	8	13422	13429	25 %	50 %	25 %	0 %	379732341
266	NC_016936	TTC	2	6	13447	13452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379732341
267	NC_016936	GGC	2	6	13461	13466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379732341
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269	NC_016936	AGC	2	6	13500	13505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379732341
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397	NC_016936	CGA	2	6	20460	20465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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400	NC_016936	A	6	6	20507	20512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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